Introduction

The page is a part of the Search module of the R-loopAtlas. Users can search R-loops by region of chromosome. Then the search results will be exhibited in a table and visualized by JBrowse. The results including genes and R-loops in the search region.

Search for R-loops by Region

Species
Chromosome Number
Start
End
Upstream kb
Downstream kb
                         
Tip
  Arabidopsis thaliana Glycine max
Sequence region
  • Chr1 : 1 -> 30427671
  • Chr2 : 1 -> 19698289
  • Chr3 : 1 -> 23459830
  • Chr4 : 1 -> 18585056
  • Chr5 : 1 -> 26975502
  • Chr1 : 1 -> 59249829
  • Chr2 : 1-> 52160593
  • Chr3 : 1 -> 47695029
  • Chr4 : 1 -> 53978414
  • Chr5 : 1 -> 45299532
  • Chr6 : 1 -> 51952677
  • Chr7 : 1 -> 46590119
  • Chr8 : 1 -> 49896852
  • Chr9 : 1 -> 51486896
  • Chr10 : 1 -> 54067360
  • Chr11 : 1 -> 40746315
  • Chr12 : 1 -> 44494750
  • Chr13 : 1 -> 47100052
  • Chr14 : 1 -> 53013617
  • Chr15 : 1 -> 53421904
  • Chr16 : 1 -> 38265740
  • Chr17 : 1 -> 42350739
  • Chr18 : 1 -> 60669500
  • Chr19 : 1 -> 52317195
  • Chr20 : 1 -> 52284028
  Oryza sativa Japonica Zea mays
Sequence region
  • Chr1 : 1 -> 43270923
  • Chr2 : 1-> 43270923
  • Chr3 : 1 -> 36413819
  • Chr4 : 1 -> 35502694
  • Chr5 : 1 -> 29958434
  • Chr6 : 1 -> 43270923
  • Chr7 : 1 -> 43270923
  • Chr8 : 1 -> 43270923
  • Chr9 : 1 -> 43270923
  • Chr10 : 1 -> 43270923
  • Chr11 : 1 -> 4327092
  • Chr12 : 1 -> 43270923
  • Chr1 : 1 -> 308452471
  • Chr2 : 1 -> 243675191
  • Chr3 : 1 -> 238017767
  • Chr4 : 1 -> 250330460
  • Chr5 : 1 -> 226353449
  • Chr6 : 1 -> 181357234
  • Chr7 : 1 -> 185808916
  • Chr8 : 1 -> 182411202
  • Chr9 : 1 -> 163004744
  • Chr10 : 1 -> 152435371